Nazwa instytucji finansującej: Narodowe Centrum Nauki
Informacja o finansowaniu lub dofinansowaniu zadania z budżetu państwa lub z państwowych funduszy celowych: Finansowanie ze środków budżetu państwa
Rodzaj dotacji budżetowej lub nazwa programu lub funduszu: OPUS 27
Nazwa zadania/projektu: Genomika krajobrazu na poziomie indywidualnym w ochronie zasobów genowych kluczowych gatunków drzew leśnych
Wartość finansowania lub dofinansowania i całkowita wartość zadania/projektu: 2 244 800PLN
Kierownik zadania/projektu: Kierownik projektu: prof. dr hab. Jarosław Burczyk, burczyk@ukw.edu.pl
Nazwa jednostki realizującej zadanie/projekt: Uniwersytet Kazimierza Wielkiego, Wydział Nauk Biologicznych, Katedra Genetyki
Okres realizacji: 09.01.2025-08.01.2029
Nr umowy/decyzji: UMO-2024/53/B/NZ9/03222
Status zadania/projektu: w trakcie realizacji
Obsługa administracyjno-finansowa zadania/projektu: Dział Nauki
Krótki opis zadania/projektu:

Głównym celem projektu jest opracowanie spójnej geograficznie strategii ochrony i zarządzania leśnymi zasobami genowymi rodzimych dębów w oparciu o analizy genomowe. Zidentyfikowane będą obszary leśne wyróżniające się genetycznie i ewolucyjnie, oraz regiony geograficzne o największej lub lokalnie specyficznej różnorodności genetycznej. Zbadane będą relacje między różnorodnością genomową a zmiennymi środowiskowymi, co pozwoli na zrozumienie mechanizmów leżących u podstaw istnienia przestrzennych wzorców różnorodności genomowej związanych z adaptacją.

Innowacją projektu będzie opracowanie pangenomów dębu szypułkowego i bezszypułkowego, które posłużą jako zaawansowane referencje do oceny różnorodności genomowej w obrębie każdego gatunku. Różnorodność genomowa badana będzie za pomocą wszystkich dostępnych typów polimorfizmów, takich jak SNP (polimorfizm pojedynczego nukleotydu), InDels (polimorfizm insercji/delecji) i warianty strukturalne (SV), w tym CNV (zmienność liczby kopii), PAV (obecność/brak fragmentów genomu), inne SV (np. inwersje, translokacje, duplikacje segmentowe). Ponadto, w celu wykrycia przestrzennych wzorców różnorodności genomowej zastosowane będą nowatorskie metody analizy danych w oparciu o pojedyncze osobniki wytypowane w ramach zasięgów gatunków w Polsce. Zweryfikowanych zostanie kilka istotnych hipotez badawczych dotyczących organizacji genomu, asocjacji pomiędzy genomem a zmiennymi klimatycznymi, filogeografii oraz stopnia dywergencji i hybrydyzacji między gatunkami dębów. Wyniki badań będą miały istotne znaczenie dla rozwoju genomiki drzew leśnych oraz ochrony zasobów genowych dębów.